Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ATP5F1P24539 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms