Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TNFSF4P23510 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms