Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPREP23469 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTPREP23469 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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