Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGA6P23229 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms