Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TAF1P21675 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TAF1P21675 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1P21675 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TAF1P21675 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TAF1P21675 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TAF1P21675 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TAF1P21675 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms