Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMB1P20618 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSMB1P20618 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms