Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM21P19474 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRIM21P19474 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms