Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DESP17661 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DESP17661 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DESP17661 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms