Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GABRA1P14867 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms