Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
VPREB1P12018 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms