Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SFTPCP11686 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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