Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ITGA5P08648 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms