Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FGF1P05230 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms