Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CBX7O95931 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CBX7O95931 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms