Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDX58O95786 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDX58O95786 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX58O95786 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms