Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCNKO75909 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCNKO75909 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNKO75909 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms