Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NPHP4O75161 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPHP4O75161 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms