Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTNSO60931 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms