Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOFO60613 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOFO60613 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms