Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPLO60437 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPLO60437 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPLO60437 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPLO60437 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPLO60437 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms