Protein–RNA interactions for Protein: O60361

NME2P1, Putative nucleoside diphosphate kinase, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P1O60361 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME2P1O60361 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms