Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SPAG9O60271 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SPAG9O60271 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms