Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TIMM8AO60220 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TIMM8AO60220 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms