Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SCO2O43819 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms