Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PRPF3O43395 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms