Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRODHO43272 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRODHO43272 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRODHO43272 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRODHO43272 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRODHO43272 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRODHO43272 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRODHO43272 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms