Protein–RNA interactions for Protein: O15258

RER1, Protein RER1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RER1O15258 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RER1O15258 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RER1O15258 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RER1O15258 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RER1O15258 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RER1O15258 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RER1O15258 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms