Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBDO15205 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBDO15205 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBDO15205 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBDO15205 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UBDO15205 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBDO15205 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms