Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNMO15061 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYNMO15061 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNMO15061 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNMO15061 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms