Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOCS6O14544 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms