Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AGRNO00468 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
AGRNO00468 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
AGRNO00468 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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