Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H7C1D1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H7C1D1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H7C1D1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H7C1D1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms