Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms