Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NPIPA5E9PKD4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms