Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LINC00587B1AMM8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms