Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STRCP1A6NGW2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STRCP1A6NGW2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms