Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
E2F8A0AVK6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms