Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IGKV1-27A0A075B6S5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IGKV1-27A0A075B6S5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms