Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKP3Q9Y446 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKP3Q9Y446 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms