Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms