Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC8Q9Y2L5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms