Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATF5Q9Y2D1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms