Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC5Q9UQL6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC5Q9UQL6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms