Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
INO80Q9ULG1 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
INO80Q9ULG1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms