Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRPF3Q9ULD4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms