Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB23Q9ULC3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB23Q9ULC3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms