Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ERG28Q9UKR5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms