Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP68Q9UHB9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms