Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SAE1Q9UBE0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms