Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP35Q9P2H5 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP35Q9P2H5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
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